Как себе показала финальная версия CIS 3.5

К сожалению, если переносить настройки, то новые ресурсы для защиты надо будет выяснять (и включать в настройки кис) самостоятельно, либо …обходится без них.

пс:

… т. е. “настройки безопасности по умолчанию оптимизированы для защиты новых ком-интерфейсов, ключей реестра и файлов”